تعلن الهيئة أن القطار هو الخيار الأمثل للسفر إلى محافظات الصعيد لما يوفره من راحة للمسافات الطويلة. يُفضّل الكثيرون السفر بالقطارات على هذه الخطوط لما يمنحه من سلاسة وراحة أثناء التنقل. تُصدر الجهة جداول محدثة للقطارات المكيفة والروسية العادية على خطوط القاهرة-أسوان والعكس، مع عروض وخيارات متعددة حسب الدرجة. وتشدد على ضرورة الحجز المسبق قبل السفر لتأمين المقعد وتلافي الإرباك.
تتضمن الخدمات المعروضة قطارات مكيفة وروسية ومختلطة تغطي خطوط القاهرة-أسوان والعكس، إضافة إلى مسارات أخرى مثل القاهرة-الإسكندرية-أسوان. وتشمل أمثلة على الجداول المحدثة قطار 1902 مكيف القاهرة-أسوان عند الساعة 00:20 مساءً، وقطار 978 ثالثة مكيفة القاهرة-أسيوط عند 06:30 صباحًا، وقطار 2010 مكيف القاهرة-أسوان عند 10:00 صباحًا، مع وجود خيارات أخرى خلال اليوم. كما توجد رحلات على خطوط أسوان-القاهرة والإسكندرية-أسوان، وتؤكد على ضرورة الحجز المسبق قبل السفر. تراعى الجهة وجود فترات توقف وخيارات مختلفة من الدرجة والسرعة لتناسب المسافرين.