تُحضّر المسقعة بشكل يضمن تجديد مذاقها وإضفاء لمسة مميزة على طبقها التقليدي. تبدأ بتحمير شرائح الباذنجان في الزيت حتى تصبح ذهبية اللون، ثم تُصفّى من الزيت وتُحفظ جانبًا. يُحضّر حشوة الدجاج المفروم عن طريق قليه مع البصل والثوم حتى يتغير لونه، ثم يُضاف الفلفل الحار والبهارات المختلفة مثل الكمون والبابريكا والزعتر، مع الطماطم المفرومة وصلصة الطماطم، ويُترك الخليط ليغلي حتى ينضج تمامًا. لتحضير صلصة البشاميل، يُشوح الدقيق في السمنة حتى يتغير لونه، ثم يُضاف اللبن مع الملح والفلفل ويُحرك ليثقل القوام، مع إضافة جبن الفيتا ليعطيه نكهة مميزة. تُرص في صينية فرن طبقة من شرائح الباذنجان، يليه طبقة من شرائح الفلفل المقلي، ثم يُوضع خليط الدجاج، وتُكرر عملية الترتيب حتى انتهاء المكونات. يُصب أخيرًا صلصة البشاميل ويُرش فوقه الجبنة الموزاريلا، ثم يُدخل إلى الفرن على درجة حرارة مناسبة لمدة حتى ينضج ويصبح السطح ذهبيًا، ثم يُقدّم ساخنًا.